GESTIÓN

gestores y promotores especializados
de investigación biomédica

Plataforma de proteómica

Contacto
Susana B Bravo López
Susana.Belen.Bravo.Lopez@sergas.es

La plataforma de Proteómica fue creada con el objetivo de potenciar la investigación, dar soporte y ofrecer a los investigadores una infraestructura completa en el campo de la proteómica manejada por personal altamente especializado.

Está dotada con equipos de última generación que permiten realizar estudios tanto de caracterización de proteomas completos, como de análisis de expresión diferencial. Teniendo en cuenta que la causa de la mayoría de las enfermedades humanas se debe a la desregulación funcional de la interacción entre proteínas, la aplicación clínica más importante sería la búsqueda y posterior identificación de biomarcadores de las distintas patologías.

El trabajo de la Plataforma se centra en la separación, identificación, cuantificación y caracterización de proteínas en sistemas biológicos mediante cromatografía líquida multidimensional y análisis de proteómica basada en espectrometría de masas. Nuestro laboratorio está especializado en una amplia gama de enfoques para respaldar estudios relacionados con el proteoma, desde la identificación y cuantificación de proteínas individuales hasta el análisis complejo de muestras en diferentes sistemas biológicos. Además, la plataforma colabora con otros grupos en la investigación y búsqueda de diseños experimentales apropiados, ayudando en la escritura de los paper, análisis y validación de resultados, entre otros.

Por otro lado, además de nuestra principal línea de trabajo como servicio, también realizamos nuestra propia investigación, desarrollando trabajos enfocados en la optimización de protocolos, la actualización de los equipos y la introducción de nuevas técnicas para ofrecer los servicios más completos y novedosos.

Nano-HPLC (nanoLC Ultra 1D plus, AbSciex) acoplado a un Spoter- Eksigent (AbSciex)

NanoLC425 (Eksigent).
Triple TOF 6600(AbSciex).

MALDI-TOF/TOF (4800 Analyzer, AbSciex)

Servicios

  • Determinación De Masas Moleculares (DDM).
  • Identificación de proteínas mediante huella peptídica (MALDI-TOF).
  • Identificación de mezclas de proteínas mediante nanoLC-MALDI-TOF/TOF.
  • Identificación masiva de proteínas por métodos LC-MSMS (métodos DDA usando un equipo Triple TOF).
  • Cromatografía en fase reversa (Nano-HPLC).
  • Separación de proteínas mediante electroforesis monodimensional (SDS-PAGE).
  • Separación de proteínas mediante Electroforesis Bidimensional (2-DE).
  • Proteómica Diferencial con marcaje· 2D-DIGE, ITRAQ, SILAC.
  • Proteómica Diferencial sin marcaje “label free” SWATH.
  • Modificaciones Postraduccionales (PTM) ·fosforilaciones, glicosilaciones, glicaciones…
  • Manejo de distintos programas para el análisis de datos: ProteinPilot para la identificación de proteínas; Peak View, Marker View y Skyline para la cuantificación de proteínas…PEAKS para estudio de modificaciones posttraduccionales y Secuenciación de Novo.
  • Otros servicios:
    • Escaneado de geles
    • Preparación de muestras
    • Asesoramiento en el diseño experimental de análisis proteómicos
    • Análisis de datos en bases informáticas

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